Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RESTQ13127 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RESTQ13127 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RESTQ13127 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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RESTQ13127 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RESTQ13127 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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