Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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TRAF3Q13114 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRAF3Q13114 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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