Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TRAF1Q13077 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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