Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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