Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CPSF1Q10570 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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