Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTPAP49638 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTPAP49638 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTPAP49638 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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