Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXA13P31271 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXA13P31271 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXA13P31271 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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