Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTIFO43310 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTIFO43310 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CTIFO43310 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CTIFO43310 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CTIFO43310 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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