Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc2Q9Z2H7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gipc2Q9Z2H7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gipc2Q9Z2H7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gipc2Q9Z2H7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gipc2Q9Z2H7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc2Q9Z2H7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms