Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K4Q9Y6R4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms