Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms