Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms