Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Thsd1Q9JM61 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Thsd1Q9JM61 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Thsd1Q9JM61 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Thsd1Q9JM61 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd1Q9JM61 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd1Q9JM61 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd1Q9JM61 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd1Q9JM61 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd1Q9JM61 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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