Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trem3Q9JKE1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trem3Q9JKE1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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