Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms