Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7aQ9CZ04 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms