Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma8Q9CWH6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma8Q9CWH6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms