Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med4Q9CQA5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med4Q9CQA5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms