Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms