Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxc12Q8K5B8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc12Q8K5B8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc12Q8K5B8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc12Q8K5B8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc12Q8K5B8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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