Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1rbQ8CFG9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms