Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EfhbQ8CDU5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EfhbQ8CDU5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms