Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms