Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
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