Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssx9Q6XAS3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssx9Q6XAS3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms