Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms