Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LbrQ3U9G9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LbrQ3U9G9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms