Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PTPRNQ16849 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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