Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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