Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms