Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms