Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fermt1P59113 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms