Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms