Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PctpP53808 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PctpP53808 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PctpP53808 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PctpP53808 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms