Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms