Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CratP47934 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CratP47934 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CratP47934 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CratP47934 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms