Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms