Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppm1bP36993 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms