Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms