Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms