Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms