Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nme6O88425 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme6O88425 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms