Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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