Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Top6blJ3QMY9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Top6blJ3QMY9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Top6blJ3QMY9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Top6blJ3QMY9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top6blJ3QMY9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top6blJ3QMY9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms