Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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