Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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