Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRERF1Q96PN7 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms