Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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