Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP13-3Q3SY46 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms