Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTU2Q2VPK5 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTU2Q2VPK5 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms